パーシステントホモロジーの勉強の為，ラップトップでDionysus 2が動くようにした．
https://mrzv.org/software/dionysus2/index.html
パーシステンスの例として，ある整数係数上の1次元コサイクルを空間から円への写像に対応すると考え，パーシステントコサイクルの検出を試みた．Dionysus 2でのサンプルデータは以下の通りとなる．
細胞性粘菌三種の群集における私のPzDomモデル
https://browse.arxiv.org/abs/1603.00959
のsが配置される空間と円との関係を計算すると，結果は勿論円にはならない．
しかし，分布は種ごとにある程度分かれる．このプロット上は左上が先駆種としての傾向を，右下が極相種としての傾向を示す．Polysphondylium属よりも多様性の高いDictyostelium属の方がトポロジーに応じてマーキングされた色がバラバラで，まとまりがないことを表している．
詳細は検討中だが，もっと勉強して深めて行くとともに，土壌動物群集のデータをたくさんとって19点しかない現行のデータよりも説得力を持たせるつもりだ．
【追記】細胞性粘菌の系のパーシステンス図もプロットしてみた．対角線上の細かく意味のない構造の他に，そこから隔った大きな構造が1つあることが示されている．
