Entries from 2020-03-01 to 1 month

The Garden of Sinners "Epilogue"

In the “Epilogue” of the animation series “The Garden of Sinners”, the essence of this story is settled in a dialogue on one snowy day. Conflicts between intelligence originated from spirit and soul originated from flesh are discussed, as …

pet #13 (with P.S.)

On March the 30th 2020, I watched the 13th episode of the animation series “pet”. It was painful to see a decomposing of one’s mind. Katsuragi finally regains his truth and has set off to his last journey. The awkwardness of him is explain…

BLOOD-C

If you are interested in a story of a certain person being stalked by all the surrounding people, you may like the animation series “BLOOD-C” and “BLOOD-C The Last Dark”. “Elder Bairns”, who are inspired by H.P. Lovecraft’s Cthulhu Mythos,…

PCRキャパシティーに関する調査

COVID-19に関するPCR検査のキャパシティーに関する調査案内がうちの研究室にも2週間くらい前になってようやく来ていたらしい.PCR検査を積極的にしないのは何か特別な理由があってそうしないのではなく,ただ単にタテ割りなどで対応が恐ろしく後手後手になっ…

Magia Record 1st Season

In this story, the divergence between human and ape is set at 13 Myrs ago, which is supported by molecular evolution data between human and chimpanzee (however, it is still controversial in the real world). Magius claims that people’s desi…

COVID-19の重要性

今日のニュースで感染症を罹患した方だけが病人ではなく,他にももっと高度な医療を必要としている方々がおられるので云々という医師の方のコメントを聞きました.医療関係者でどなたかCOVID-19以外の病気で亡くなられている方が一定期間でどの程度おられる…

生物記号論

今投稿中の3本のpreprint,最後に書いたものは一番審査が難航していて,アナロジーが曖昧で数学と生物学との対応がよく分からんという意見になるみたい.例えばこのシンボルで表されるものが何なのか分からない,というのだけれど,引用されている前2本のpre…

PSYCHO-PASS 3 FIRST INSPECTOR

On March the 27th 2020, I watched an animation movie “PSYCHO-PASS 3 FIRST INSEPCTOR”. It is an action movie going through all the 135 minutes, with a scent of psychological welfare. This time, many-sided plots of the story was ongoing, and…

無症状病原体保有者

SARS-CoV-2に関し,2020/03/23 23:42 (JST) 時点で日本の無症状病原体保有者と思しき人の数が111に対し,感染者と思しき人全体の数が1129.中国だと前者が少なくとも43000,後者が120000ほど,アメリカ合衆国だと前者が後者の11倍以上に上るという見積もりが…

pet #12

On March the 23rd 2020, I watched the 12th episode of the animation series “pet”. Now Hayashi has succeeded in sending the message to Satoru, which mentions Katsuragi’s hidden memory – the memory that is the very beginning of this story an…

クロロキン

トランプがよくmentionしているクロロキンという薬剤,ヒドロキシじゃない方は僕も昔,DNAのねじれ具合を定量するのに使ったことがある.染色体研究者はクロロキンと言えば普通は上記の目的で使う物として認識している. https://www.microbiologyresearch.o…

気管支喘息の薬は確かにCOVID-19に効きそうですね

オルベスコ(シクレソニド) https://www.kegg.jp/medicus-bin/japic_med?japic_code=00059259 既に認可済みで副作用も少なそうです.PPLA2などを阻害し,炎症・痛み・免疫反応を誘導するアラキドン酸の生成を阻害する(ウイルスの増加も抑制?)などの効果…

Magia Record

In the 12th episode of the animation series “Magia Record: Puella Magi Madoka Magica Side Story”, finally a new idea besides the ideas proposed in “Puella Magi Madoka Magica” was launched out. It was very long to reach this milestone. By t…

変な先生が暴走するアニメが終わった

主人公自身こそが偽物で,大部分のmalignant matterの元だというヤツ.でもこのアニメの登場人物,基本的に皆コミュケーション不足が目立つ.

PCRのセッティング

SARS-CoV-2のPCRでfalse positiveが出て来るというPCR産物の電気泳動の写真を見ましたが,mockであるものにバンドが出ています.Mockとして鋳型DNAの溶液でなくただの超純水を使ったのなら,バンドが出る筈がないのでそれはPCRそのものよりもサンプル間のコ…

言葉の使い方

分子生物学の実験では数十年以上前から特殊な実験以外はdisposableなプラスチックウェアを使い,サンプルに接触する物は基本的に使い捨て,PCRはその最たる物です.以前の検査の検体の環境中の残渣によるキャリーオーバーは,伝説としてはありますが,practi…

pet #11

On March the 16th, I watched the 11th episode of the animation series, “pet”. Satoru is very sharp and gradually it became apparent that Katsuragi is in several means the key for deciphering this story. One need the key for lock out anybod…

malignant matterの活性化

Malignant matterがどうたらこうたらとか言うアニメを見ているけれど,何でもchemical synthesizerとか言うもので薬を作って撃ち込んでいるらしい(別に感染症ではないのでワクチンは関係ない). Harvard UniversityやHarvard Medical School,MITもシャッ…

楓!エビデンスを鵜呑みにしない!

これ絶対にネタアニメだよなあ...

ウイルス学の専門家の不在

何だか良く分からないけれど,取り敢えずウイルス学の専門家がほとんど表に出て来ないので,ウイルス学や分子生物学関連の知見が厚生労働省も含めてしっちゃかめっちゃかに掻き回されているとのことでした.先日ネタに混ぜましたが,公共的に意味のある言説…

A.I.C.O. Incarnation

この黒部峡谷を登山しているのだか何だか良く分からないアニメは結構面白い.

【追記あり】イギリスの首相顧問の発言

イギリスの首相顧問が 人口の60%ほどの4000万人の人々にコロナウイルスを感染させ,免疫をつけさせてアウトブレイクに対応すると言っているらしいですね. https://www.dailymail.co.uk/news/article-8108271/Chief-scientific-adviser-wants-60-percent-ent…

【追記あり】デマ(繰り返しますけど,原著論文読まないとダメですからね,こういうの)

COVID-19の話題はあまりしたくないのだけれど,怪しげな言説には事欠かないので例を2つ. PCR検査の「偽陰性」「偽陽性」(という言葉を使うこと自体が誤りらしいが)を心配する人が,PCR検査はダメだということでほぼ確実にそれより感度も特異度も何桁か悪…

別役実さん

劇作家の別役実さんが亡くなられました. https://www.nikkei.com/article/DGXMZO56614030Q0A310C2CZ8000/ 私は好きな劇作家の岸田國士戯曲賞受賞作品だけは自宅に揃えていますが,別役実さんのものは『マッチ売りの少女/象』(三一書房). https://www.ama…

総説

コロナウイルスについての英文総説を読んだのだけれど,しっかりした人が書いた文献は引用文献もまたしっかりしている.ネットを見ていると総説で文献の引用は一応しているみたいでも,情報がやけに古かったり,時間スケールが妙だったり,Methodsの記述がさ…

pet #10

On March the 9th 2020, I watched the 10th episode of the animation series “pet”. From this episode, one starts to be aware that it is hard to determine whether contacting information from outer worlds or cutting off all the information is …

もう完全にデマッターアカウント化していますな

多くの人があれだけ口を酸っぱくして,数値的評価が必要な時はそれに依拠しない議論は不毛だし,数値があろうがなかろうがはっきりとした根拠を持ちましょうと言っているのに,話の内容がほとんど何をどうやって調べたのかも分からない単なるデマに依拠して…

SARS-CoV-2の学術論文

SARS-CoV-2について,しっかりした知見を元に語りたい場合は以下の論文を先ずは読んでみましょう. https://www.nejm.org/doi/doi/full/10.1056/NEJMoa2001017 https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30251-8/fulltext これ,…

マギアレコード-3

ウイルスの入った絵の具を浴びると,おかしくなるらしい.

2009年新型インフルエンザ

2009年新型インフルエンザ(A(H1N1)pdm09)のパンデミック時の日本の対応の話が纏められていました. https://www.cas.go.jp/jp/influenza/kako_03.html https://www.cas.go.jp/jp/influenza/kako_04.html 今回のCOVID-19の話とは,原因となるSARS-CoV-2とA(…